Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMURF2Q9HAU4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMURF2Q9HAU4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMURF2Q9HAU4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms