Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SUGCTQ9HAC7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SUGCTQ9HAC7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUGCTQ9HAC7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUGCTQ9HAC7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUGCTQ9HAC7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms