Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD1Q9GZZ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD1Q9GZZ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD1Q9GZZ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD1Q9GZZ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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