Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HOXD1Q9GZZ0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HOXD1Q9GZZ0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXD1Q9GZZ0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXD1Q9GZZ0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXD1Q9GZZ0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXD1Q9GZZ0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXD1Q9GZZ0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXD1Q9GZZ0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXD1Q9GZZ0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXD1Q9GZZ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXD1Q9GZZ0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXD1Q9GZZ0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXD1Q9GZZ0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXD1Q9GZZ0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXD1Q9GZZ0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXD1Q9GZZ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXD1Q9GZZ0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXD1Q9GZZ0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXD1Q9GZZ0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HOXD1Q9GZZ0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXD1Q9GZZ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXD1Q9GZZ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXD1Q9GZZ0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXD1Q9GZZ0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXD1Q9GZZ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXD1Q9GZZ0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXD1Q9GZZ0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXD1Q9GZZ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HOXD1Q9GZZ0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXD1Q9GZZ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXD1Q9GZZ0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXD1Q9GZZ0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXD1Q9GZZ0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXD1Q9GZZ0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXD1Q9GZZ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD1Q9GZZ0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD1Q9GZZ0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD1Q9GZZ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD1Q9GZZ0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD1Q9GZZ0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD1Q9GZZ0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD1Q9GZZ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD1Q9GZZ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXD1Q9GZZ0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD1Q9GZZ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXD1Q9GZZ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD1Q9GZZ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD1Q9GZZ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD1Q9GZZ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD1Q9GZZ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD1Q9GZZ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD1Q9GZZ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD1Q9GZZ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD1Q9GZZ0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD1Q9GZZ0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD1Q9GZZ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD1Q9GZZ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD1Q9GZZ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXD1Q9GZZ0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD1Q9GZZ0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD1Q9GZZ0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXD1Q9GZZ0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD1Q9GZZ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD1Q9GZZ0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD1Q9GZZ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD1Q9GZZ0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD1Q9GZZ0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD1Q9GZZ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD1Q9GZZ0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD1Q9GZZ0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD1Q9GZZ0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD1Q9GZZ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD1Q9GZZ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD1Q9GZZ0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD1Q9GZZ0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD1Q9GZZ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD1Q9GZZ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD1Q9GZZ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD1Q9GZZ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD1Q9GZZ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD1Q9GZZ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD1Q9GZZ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD1Q9GZZ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD1Q9GZZ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD1Q9GZZ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD1Q9GZZ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD1Q9GZZ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD1Q9GZZ0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD1Q9GZZ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD1Q9GZZ0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD1Q9GZZ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD1Q9GZZ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD1Q9GZZ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms