Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPO4Q9C0E2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPO4Q9C0E2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.57■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XPO4Q9C0E2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
XPO4Q9C0E2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms