Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM15Q9C019 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM15Q9C019 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM15Q9C019 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM15Q9C019 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms