Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHCBP1LQ9BZQ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHCBP1LQ9BZQ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHCBP1LQ9BZQ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHCBP1LQ9BZQ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHCBP1LQ9BZQ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.8 ms