Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNG6Q9BXT2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNG6Q9BXT2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNG6Q9BXT2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms