Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP5Q9BXF6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.2 ms