Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHD1Q9BUP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFHD1Q9BUP0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFHD1Q9BUP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms