Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TM2D3Q9BRN9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM2D3Q9BRN9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM2D3Q9BRN9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms