Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SDF4Q9BRK5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SDF4Q9BRK5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SDF4Q9BRK5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SDF4Q9BRK5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms