Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL3Q99963 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL3Q99963 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3GL3Q99963 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms