Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD5Q99717 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD5Q99717 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms