Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SORT1Q99523 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SORT1Q99523 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SORT1Q99523 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SORT1Q99523 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms