Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HAPLN3Q96S86 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HAPLN3Q96S86 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HAPLN3Q96S86 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HAPLN3Q96S86 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HAPLN3Q96S86 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HAPLN3Q96S86 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HAPLN3Q96S86 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HAPLN3Q96S86 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HAPLN3Q96S86 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms