Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CSRNP1Q96S65 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSRNP1Q96S65 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CSRNP1Q96S65 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CSRNP1Q96S65 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CSRNP1Q96S65 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CSRNP1Q96S65 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms