Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP5Q96RT8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms