Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UIMC1Q96RL1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UIMC1Q96RL1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UIMC1Q96RL1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms