Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RMDN2Q96LZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN2Q96LZ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN2Q96LZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RMDN2Q96LZ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN2Q96LZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN2Q96LZ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN2Q96LZ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN2Q96LZ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms