Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNPC3Q96LT9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNPC3Q96LT9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNPC3Q96LT9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNPC3Q96LT9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms