Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCPIP1Q96JH7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPIP1Q96JH7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VCPIP1Q96JH7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms