Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSL1Q96IY1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSL1Q96IY1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSL1Q96IY1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSL1Q96IY1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSL1Q96IY1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSL1Q96IY1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSL1Q96IY1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSL1Q96IY1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSL1Q96IY1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSL1Q96IY1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSL1Q96IY1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSL1Q96IY1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms