Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSANTD3Q96H12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSANTD3Q96H12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSANTD3Q96H12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms