Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms