Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTERF3Q96E29 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTERF3Q96E29 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTERF3Q96E29 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms