Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RFT1Q96AA3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFT1Q96AA3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFT1Q96AA3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms