Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTSSAQ969W0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTSSAQ969W0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTSSAQ969W0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms