Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFKQ969G6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFKQ969G6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFKQ969G6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms