Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RAPGEF4Q8WZA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAPGEF4Q8WZA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAPGEF4Q8WZA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAPGEF4Q8WZA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RAPGEF4Q8WZA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF4Q8WZA2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms