Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CKAP2Q8WWK9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CKAP2Q8WWK9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2Q8WWK9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2Q8WWK9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2Q8WWK9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms