Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC4Q8WW27 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC4Q8WW27 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC4Q8WW27 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms