Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HELQQ8TDG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HELQQ8TDG4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELQQ8TDG4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.58■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELQQ8TDG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms