Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR48Q8TAF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR48Q8TAF3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR48Q8TAF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR48Q8TAF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR48Q8TAF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR48Q8TAF3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms