Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOSQ8NHW6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
OTOSQ8NHW6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTOSQ8NHW6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTOSQ8NHW6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOSQ8NHW6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
OTOSQ8NHW6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOSQ8NHW6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTOSQ8NHW6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOSQ8NHW6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOSQ8NHW6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTOSQ8NHW6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OTOSQ8NHW6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OTOSQ8NHW6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms