Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF555Q8NEP9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF555Q8NEP9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms