Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11CQ8NB49 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP11CQ8NB49 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11CQ8NB49 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11CQ8NB49 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11CQ8NB49 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP11CQ8NB49 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP11CQ8NB49 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11CQ8NB49 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP11CQ8NB49 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11CQ8NB49 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms