Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FSIP1Q8NA03 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FSIP1Q8NA03 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FSIP1Q8NA03 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FSIP1Q8NA03 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms