Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STAG2Q8N3U4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STAG2Q8N3U4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STAG2Q8N3U4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
STAG2Q8N3U4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms