Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PELI3Q8N2H9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PELI3Q8N2H9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PELI3Q8N2H9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms