Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
P3H3Q8IVL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
P3H3Q8IVL6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
P3H3Q8IVL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.44■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
P3H3Q8IVL6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
P3H3Q8IVL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
P3H3Q8IVL6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms