Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN12Q6ZSI9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN12Q6ZSI9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN12Q6ZSI9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms