Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM53Q6P2H8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM53Q6P2H8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM53Q6P2H8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms