Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LETMD1Q6P1Q0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LETMD1Q6P1Q0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms