Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT4

SLC30A6, Zinc transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A6Q6NXT4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC30A6Q6NXT4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC30A6Q6NXT4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC30A6Q6NXT4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A6Q6NXT4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A6Q6NXT4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A6Q6NXT4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A6Q6NXT4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC30A6Q6NXT4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms