Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
REEP3Q6NUK4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REEP3Q6NUK4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REEP3Q6NUK4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms