Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXI9

LIPN, Lipase member N, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPNQ5VXI9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPNQ5VXI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPNQ5VXI9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIPNQ5VXI9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPNQ5VXI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms