Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP6Q5VW22 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP6Q5VW22 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP6Q5VW22 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP6Q5VW22 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP6Q5VW22 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP6Q5VW22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP6Q5VW22 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP6Q5VW22 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP6Q5VW22 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP6Q5VW22 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms