Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC04

ATP1A1-AS1, Putative uncharacterized protein ATP1A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1-AS1Q5TC04 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A1-AS1Q5TC04 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A1-AS1Q5TC04 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A1-AS1Q5TC04 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A1-AS1Q5TC04 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A1-AS1Q5TC04 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A1-AS1Q5TC04 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms