Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2LQ5T4T6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP2LQ5T4T6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP2LQ5T4T6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCP2LQ5T4T6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms